- Audu materiāls nav fiksēts – materiāla autolīze;
- Audu materiāls ievietots nepareizā fiksācijas šķīdumā (skābē, dezinfekcijas šķīdumā, ūdenī u.c.) vai šķīdumā ar neatbilstošo koncentrāciju - audi deformējas vai autolīzējas;
- Audu materiāls apdedzināts – pazūd vai deformējas šūnu kodoli;
- Audu materiāls sasaldēts – audu materiāla tiek dzēsta struktūra, pazūd kodoli u. c. struktūras;
- Audu materiāls deformēts (manipulācijas laikā vai neatbilstoši ievietotā konteinerī) – precīzi nevar noteikt anatomiskās daļas, tumora izmēru u.c.;
- Nepietiekoša vai neprecīza klīniska informācija;
- Iekšējie (t.s. pacienta/slimnieka) faktori:
7.1. pielietota pirms audu paraugu ņemšanas lokāla vai sistēmiskā ārstēšana - ķīmijterāpija, staru terāpija, hormonālas un/vai pretsēnīšu ziedes utt.),
7.2. sekundārs iekaisums,
7.3. hormonālas disfunkcijas,
7.4. blakusslimības ar vai bez saņemtas ārstēšanas: latentās infekcijas (HCV, TBC, CMV u.c.), imunodeficīti, sistēmiskās vai onkoloģiskās saslimšanas.