Patoloģijas institūta galvenais darba uzdevums diagnosticēt un raksturot patoloģiskus procesus pacientu biopsijas, operācijas un autopsijas materiālā audu un šūnu līmenī, kā arī nepieciešamības gadījumā noteikt specifisko marķieru ekspresiju audos, lai pēc tam būtu iespējams izvēlēties un pielietojot specifisku, efektīvu un adekvātu ārstēšanu pacientiem gan ar onkoloģiskām (krūts, plaušu vēzis, limfoma u.c.), gan arī citam NE-onkoloģiskam saslimšanām (čūlains kolīts, psoriāze, sarkoidoze u.c.).
Patoloģijas institūts aprīkots ar atbilstošām modernām tehnoloģijām, ar strādā atbilstoši apmācīts un kvalificēts medicīniskais personāls, ir kompetents veikt izmeklēšanu atbilstoši LVS EN ISO 15189:2022 standarta prasībām.
Patoloģijas institūtā ir apmācības bāze Rīgas Stradiņa universitātes un Latvijas Universitātes ārstiem - rezidentiem, patoloģijas un arī citu nozaru speciālistiem. Patoloģijas institūtā tiek veikta pētnieciskā darbība sadarbībā ar universitātēm un pētniecības centriem.